615
KLINICKÁ341804301074588109168189242288347
FARMAKOLOGIE709804301074291138211265312372415474533554598
A13288043010753
FARMACIE1403804301074191138210265316336380
/18298043010732
Klin190680430107446583131
Farmakol2057804301074278105179220258305325
Farm.2402804301074178104179195
2024;38(3):118-1222617804301074487128168183227270294336357372409444483511550587631
/32938043010732
www.klinickafarmakologie.cz4568804301076513320121425327329234035839843647950254457164568672477179183988990895196610061045
1201308026012657110167
PŘEHLEDOVÉ341207012660124182256312369444520587645
ČLÁNKY1008207012660115187259327395
Vazebné34136501063673107139175217248
síly:6053650106314879112125
typy74536501063069104141
interakcí9023650106155688120156198233266284
léčiv12023650106286196113151
s1369365010631
molekulovými141536501065293124156192233264304341380433451
cíli1881365010633508299
v1996365010636
organismu204836501063874114154195213245299339
bitory34362101095173103152182228
protonové59762101095181130160210260310353398
pumpy1020621010951102177229271
či131662101094162
warfarin1403621010966111140169214244265315
(10,174462101092568110129
11).189862101094684103121
Jako34376101093377119168
příklad53676101095181102146169213264
kovalentního82576101094291134178199245295325375396448498
inhibitoru134876101092171121142193215245294324374
kinázy-174776101094265115159198243272
-receptoru34390101092861108151198252284335366419
pro79090101095384136
epidermální954901010947100123177225256335380403455478
růstový146090101093083120152203248296
faktor178490101092774118152203235
(EGF)343104101092672132179207
z5791041010939
3.647104101094867
generace7431041010952100153201232278321367
je1139104101092370
uveden1238104101095197144198246299
osimertinib1566104101095088110188236268302325377400453
indikovaný343118101092171122144186235278322372413
k7811181010942
léčbě848118101092167109160206
specifických1079118101093687133175196223246287329375415465
případů1569118101095181102154198249299
nemalobuněčného18931181010950963431321010975119140190242292342388429479525576626
karcinomu990132101094287117157178228278354403
plic.141513210109517394135154
Na15911321010959103
obr.17161321010949101131146
218841321010946
je1951132101092268
patrná343146101095195124153203246
kovalentní605146101094290132176197242292321370391
vazba1012146101094386125176220
s12481461010935
cysteinem1299146101094084120150194216265310385
797,1700146101094690134144
dále1859146101095194115160
vodíkové343160101094493145166211260303348
vazby717160101094387127179222
s9641601010936
několika1026160101095096139188210232274319
aminokyselinami13711601010944119141191241285331367413435456507551626648
(přerušovanou343174101092576105149179228263312354397446495544
čarou903174101094083112160210
v11281741010943
2D11861741010946104
zobrazení)1305174101093887138167211249294343364393
a17131741010943
hydrofobní1772174101094990139168217343188101092676128178200
interakce560188101092171101145175219262301346
indolového923188101092171123173195245288332383433
bicyklu1373188101095173114159202225274
s16651881010935
valinem1718188101094387108129179225301
726343202101094692137
(aren-H49920210109256696141192221282
přerušovanou800202101095181126156206242292334378428478529
čarou).1348202101094084114163213237254
Ostatní,483216101096399131175206256278297
energeticky806216101094697143173225271302323365407454
mnohem12862161010975126177228275351
slabší1663216101093658102154190212
vazebné1901216101094388343230101093883134184229
síly58823010109355679121
označujeme725230101094986136179219268289334409454
jako1195230101092265106154
nekovalentní13652298011252100149200247294319367420453506531
interakce.19112298011225773432438011233801151622112502976402441010918
Pro674244101094776125
vyvolání814244101094388134183204247297317
biologické1147244101095172121143192243263303345389
odpovědi15512441010949100151201243287338359
by1926244101095092
rozhodně343258101092978116166216267317362
nebyla721258101095095146188210253
dostačující9902581010951100136166210251300321342382403
jediná1409258101092267119140189233
interakce.1657258101092171100145174218260299344362
Léčivo343272101094288129150194243
se610272101093682
obvykle7162721010950102145191234257302
navazuje1043272101095093136180219269291336
přibližně1404272101095181103154176197236286332
dvěma1760272101095195140215259
až343286101094381
pěti440286101095196126146
takovými602286101092973115162205250325345
interakcemi,96328610109217099143172215257296340414435453
čímž1432286101094060134173
se1620286101093580
pevnost1716286101095196139189238273303
vazby343300101094387127178221
léčiva583300101092167108129173217
k8193001010942
biologickému880300101095173123145195246268308350395470520
cíli141930010109406285106
zvyšuje1544300101093884130166216237283
(5).184630010109267094111
Iontová483313801122578131164216262310
vazba808313801124795137192240
je1063314101092267
reverzibilní1146314101092973116160190230251302323344394414
nekovalentní1576314101095095137186228272293338388417343328101095071
interakce437328101092171101146176220262302346
založená806328101093984105155194239289333
na1162328101095094
přitahování1279328101095181102133177227277320364414435
opačně17373281010949101146186236282
nabitých343342101095094145167197242282332
funkčních696342101092777128170210260281321371
skupin1089342101093678128179201251
v13623421010943
molekule14273421010975125147193236286307353
léčiva1802342101092167108129173217
a3433561010943
v4033561010943
biologickém462356101095173123145195246268308350395470
cíli94935610109406184105
zprostředkovaná1071356101093890120169205236265310362405453496540590634
elektrostatickými1721356101094567113156188218267343370101093668114145167209252300378400
silami.77037010109365880125203225245
Síla104137010109466892137
interakce1204370101092274104150182227271312358
je1588370101092370
nepřímo1685370101095198151182205282334
úměrná3433841010949123169198248291
vzdálenosti649384101094383133176197242292341376407427
funkčních1092384101092676125167206255276315365
skupin1472384101093577126177198248
a17353841010943
projevuje1794384101095080129150195343398101094394116161
se520398101093682
výrazněji618398101094389119164203253299321342
v9763981010943
hydrofobním1036398101094991141171220247297348399420495
prostředí1547398101095282131167198227272324345
(4).190939810109256993110
Ve343412101095093
vodném461412101094392144194240316
prostředí802412101095282131167198227272324346
je1173412101092268
zeslabená1266412101093984120141185236283333377
solvatací.1668412101093686108152196226270311332351
Iontovou343426101092272122152201244293343
interakci710426101092172101146176220262302323
poskytuje10584261010951101137179225258308330375
např.1458426101095093145175189
ionizovaná1672426101092171121142181231274318343440101095196
karboxylová465440101094489120173225268315338389433479
kyselina970440101094390127175197219271316
ibuprofenu1312440101092274126179210261289336387438
s17774401010936
argininem1840440101094475127149343454101095172123170247
ve616454101094489
vazebném732454101094388128175227279326402
místě1161454101097698133165210
membránového13984541010976122199252282327378429473518570621
proteinu343468101095282132162208229280330
cyklooxygenázy699468101094186130153203254296342393439490534574620
(Arg1211344468101092681111162204245288
u16574681010950
PDB17334681010948108158
ID:1917468101092283102
4PH9343482101094797156204
nebo573482101095198151204
Arg120803482101095687139181223269
u10994821010951
PDB11764821010949110161
ID:1363482101092284104
4RS0).1493482101094798144192218236
Dalším17554821010961106128165187264
podtypem3434961010951102154184229281328403
může7704961010975125164209
být1003496101095193126
ion-dipólová1153495801122577131161218243297350376429476524
interakce,17004958011224781111591942422922138618011241892228621010919
která227362101094275120151195
je249462101092269
o2588621010950
něco266462101095097139188
slabší287862101093657101153190211
a3115621010944
je318562101092268
umožněna3279621010950126176215266312363407
díky371262101095173213876101094288
elektrostatickému225176101094567113156189218268303334379408429470512557632682
náboji295876101095094145196218239
jedné322376101092167119169215
molekuly3463761010975126148193236286308351
a2138901010944
opačně2208901010949102146187238284
nabitému251890101095094146168199244320371
permanentnímu291490101095299129206250300347398428478500576626
dipólu356690101095172124175198248
v21381041010943
jiné220710410109224494140
molekule.23731041010975126148194237287309355374
U27721041010959
této2857104101093075105155
skupiny3037104101093679129181203253295
interakcí3358104101092171101146176220263303324
lze3708104101092160106
zmínit21381181010939117139190212243
také2408118101093076119165
kation-π26001178011250100134161215270301357
interakce2982117801122580115164200249300341390
probíhající3398118101095283134187210263308330352394416
mezi21381321010974119157178
kladně2331132101094163106156205250
nabitou2596132101094991141162192239288
molekulou28991321010974123144189231280300349398
a33121321010943
elektronově3370132101094566110152184212261310359401444
bohatým21381461010952103155199230275353
mrakem25171461010976106151194239316
na2859146101095195
aromatických2980146101094474125202246276298339382429469520
jádrech3526146101092267119149195237288
např.2138160101095094145175189
benzenu2346160101095198148187233283333
(5).269816010109257094111
Vodíková22781738011259110167194247301350400
vazba27041738011249100144202252
(vodíkový2984174101092670121175197243294339387
můstek)33981741010978129167199246290318
je3744174101092270
definována2138188101095094121144193241283326375417
jako2570188101092264106153
silná273818810109355676125167
elektrostatická2920188101094566110152184213261296326369397418457498542
interakce347718810109217098142171214255294337
mezi21382021010975121160182
elektronově2340202101094567112155188217267317367410455
deficitním2814202101095197124148188210240290311386
vodíkem3220202101094392144165209254329
a35692021010944
elektronově36322021010945671131562138216101093060109160210253297
bohatým24612161010951102153197226272348
heteroatomem.2834216101095096127172202251296325374450496572592
Donorem34512161010960111161212242287363
vodíkové2138230101094493146167212261305350
vazby2514230101094388128180223
je2763230101092268
tedy2857230101093075128172
vodík3054230101094494146168212
s32922301010936
kladným3354230101094366110162213255332
dipólovým371223010109517221382441010951102124174217263339
momentem,24982441010975125200246297326371446466
který2984244101094375120150195
vzniká3200244101094484135156198243
díky3463244101095172117162
jeho3646244101092267118168
vazbě2138258101094490130183231
na2396258101095196
elektronově2518258101094669116160194225276328379423469
bohatý30142581010952104156201232278
atom,3319258101094475125203223
a35682581010945
tedy3639258101093177130175
odhalením21382721010950104155200222269321343421
kladně2585272101094367112165216263
nabitého2875272101095196148171202248300352
jádra3253272101092267120151196
pro3476272101095283134
další3636272101095297119156178
interakce.2138286101092172102147178223266306351370
Typickým2534286101094583136158199242289366
příkladem2926286101095182104148172216268314391
donorů33432861010951102153204234285
jsou3654286101092258109160
vodíky2138300101094596150173219267
v24373001010945
hydroxy-2513300101095295148180232275323353
nebo2898300101095199154207
aminoskupinách.31373001010944123146198251288333385439462515561604656677
Akceptorem21383141010957101143190244276327359406485
vodíkové2653314101094596150173219270315362
vazby3045314101094591132186231
jsou3306314101092360112165
elektronegativní350131410109477011816319722928121383281010951100154200232255302355378
atomy2552328101094577128208252
např.2840328101095197151184200
kyslík,3076328101094391130153176223246
dusík33583281010952105142165212
nebo36063281010952100154208
fluor,2138342101092651101152182197
resp.2361342101093075112163182
jejich256934210109226890112153203
volný2798342101094493115166208
elektronový3032342101094567113157190220270321371415461
pár.3519342101095296126142
Pro3686342101094978128
hydroxy-2138356101095193145176226268315345
a25093561010944
aminoskupiny25803561010944121143194245282325377429452503546
je3152356101092269
typické,3248356101093076130152194237283302
že3576356101093986
vodík36883561010944952138370101095173117
této2281370101093075106156
skupiny2463370101093678129181203254296
může27853701010975126165211
fungovat3022370101092677128180230274318348
jako3396370101092266109158
donor35803701010951102153203234
vodíkové2138384101094596150173219270315362
vazby2530384101094591132187231
a27923841010944
kyslík2867384101094391129152174221
nebo31183841010952100154207
dusík33553841010953105142164211
může35963841010978129170218
fungovat2138398101092677128179229273317347
jako2510398101092266109158
akceptor2694398101094386126171223253303333
jiné305339810109224393140
vodíkové3218398101094493145167211260303348
vazby3592398101094388127180222
(angl.2138412101092667118169191210
hydrogen2374412101095092143173223275321372
bond27724121010952103154206
flip-flop).300441210109265072124154182206257309333350
U33804121010959
vodíkové3465412101094393145167211261304349
vazby2138426101094387127178221
současně2380426101093686136177221256306352
dochází27544261010950100142192235274296
i30714261010922
k31144261010942
částečnému3178426101094084120151195237287332408458
překryvu36574261010951811262138440101094171116161210
interagujících236344010109206997141170212262310331351390410450498
atomů2876440101094371119192240
stejně3131440101093565108129178222
jako3368440101092164105152
je3535440101092165
tomu3615440101092977151199
u21384541010950
kovalentní2210454101094291134178199245295325375396
vazby.2629454101094387126178220235
Je2887454101093379
to2988454101093079
patrné3090454101095195125154205251
z33634541010939
porovnání34244541010951102132181224275319369390
délky2138468101095094115156200
kovalentní2353468101094289131173194238287316365385
vazby2753468101094285123174215
(0,10–0,15298246810109256987127168215263281320360
nm)33524681010949122145
s35124681010935
délkou3561468101095095116157204253
vodíkové2138482101094392143164208256299343
vazby2497482101094387126177219
0,15–0,222732482101094664104145191240258306352
nm30954821010949124
podle32354821010951101153174219
zdroje3470482101093889118168189234
(5)372048210109267094
nebo2138496101095096147198
0,26–0,322358496101094664112157206255274322366
nm27354961010950125
podle28824961010951102154175221
zdroje3125496101093890119169190236
(12).3383496101092568108132149
Silnější355449610109446586136182203239260
vodíková393462101094493146167212261305349
vazba430962101094488128181226
vzniká456062101094485136158201246
v4832621010943
případě,490162101095282104156201253299318
že524562101093984
k5355621010943
sobě542462101093686139186
vazby393476101094386124175216
interagujících41657610109217099142172215264313334355394415454503
skupin468376101093677126176197246
přistupují494476101095180101135165214264314335355
pod5314761010951101151
optimálním548176101094899393490101093051127171193244265341
úhlem4301901010950100122168244
180457190101094789137
°4719901010929
(5).47749010109267195113
Vodíková491290101095198150172216266309353
vazba529190101094488128180225
je554290101092268
rovněž3934104101092977119168212250
zodpovědná4199104101093886137187236277321371420462
za4676104101093882
intramolekulární477210410109217098127170243292313357399448468510539588608
vazby5395104101094385124174215
v39341181010944
sekundární,4004118101093682126177227279324354405427446
terciární4476118101093075106146168212242293315
a48171181010944
kvartérní4887118101094289134164197242273324346
struktuře525911810109366797148191224275305351
proteinů3934132101095079127156199219268316
a42641321010943
nukleových4321132101094997138160204253294339377426
kyselin.4761132101094186120164185205254272
Je5048132101093277
nutné5139132101094997126175219
dodat,5372132101095099149191219238
že3934146101093984
v40371461010943
roce4099146101092979120165
20234283146101094691135182
byla4484146101095193115159
českými4662146101094084120162208284306
vědci4986146101094488140181202
publikována520714610109511011531751962382873303743934160101095196
výpočetně-experimentální405616010109449214519724028631736941644749654059364167269477181987090194696910201042
studie,5124160101093769120173195241260
která5411160101094377123154199
navrhla3934174101095093135165215237280
Mezinárodní42301741010972118157178228271301350401451472
unii4718174101094999120141
pro4875174101095181130
čistou502117410109406196127175225
a52621741010943
užitnou5321174101095088110140189239289
chemii3934188101094090136212233255
(IUPAC)4214188101092647105154204255282
redefinici4521188101093075127173200224274295336357
vodíkové4903188101094493145166210259302347
vazby5275188101094387127179221
ve5522188101094388
smyslu39342021010937114157194217268
rozšíření4229202101093082121160182215262314337
definice45922021010952100128153205227269315
také4934202101093177121167
na5128202101095196
interakce5251202101092173104150182227271313359
hydridového3934216101095091142171193244294337382432482
vodíku,4440216101094492144166210260279
kde4743216101094292138
má49052161010975119
vodík5048216101094392144165210
částečný5282216101094084120150195237286328
záporný3934230101093984135186216266308
náboj4262230101095093145195217
(X’−Hδ−···Y’δ+449923010109267897148209470823070642962477123010109193858101121488923070642961
a49702301010943
dihydrogenová5033230101095172122164214244293345390441491533577
vazba3934244101094387127178223
X’−Hδ−···H’δ+−Z)417624410109517012118243582447064296244212441010919385811713745552447064296146182441010954101128
(13).4765244101092668108131148
Pojmosloví4074258101094896118193243279300350393415
v45122581010943
oblasti45772581010950102124167203234255
van4854258101094488138
der5014258101095197127
Waalsových51632581010976118162183218268311357397447
sil393427210109365880
není4040272101095197149170
v42372721010944
odborné43072721010950103155207238289336
literatuře466927210109224374120151196226277307353
jednotné,5048272101092269122173224255306352371
proto54452721010952831343934286101093182
je4053286101092371
zde4161286101093993142
uvedena4339286101095198145200248302348
definice47232861010953101130156209232275322
IUPAC.5082286101092284135188241264
Podle53832861010949100155178227
ní3934300101095174
tyto4042300101093179114165
síly424230010109365984129
zahrnují4406300101093987140171224277300323
interakce4763300101092275106153185232276318365
dipól-dipól5162300101095376130183207238294317371424448
(Keesomovy3934314101092573117163199248323373415461
síly),441131410109355679121146162
interakce4589314101092171100144174218260299343
dipól-indukovaný4948314101095071122172194223245295346395437485528571621662
dipól3934328101095173125176198
(Debyeovy4158328101092686133185228273324368414
indukční4598328101092172124174217257307329
síly)495332810109365781124149
a51283281010943
elektrostatické5197328101094668114158191221271307338383393434210109315395140186
interakce4148342101092274105152183229273315361
mezi45373421010978126167189
indukovanými4754342101092274128180224275320365418461540563
dipóly,5345342101095274128181204249265
tj.393435610109305272
Londonovy4033356101094393145198249301352396443
disperzní4502356101095274110162210241282334356
síly488435610109365882126
(14–16).5036356101092670112162204247272289
Dipóldipólové53523558011264901462002273934369801125480135189215269316364
interakce4323369801122579113161197246296336385
jsou4734370101092258109160
založené4920370101093984106157196242293339
na5285370101095195
interakcích54063701010921721021481783934384101094386125146187237
částečně4189384101094185120151196237287333
kladně4540384101094365109160210256
a48153841010943
částečně4877384101094084120150195236286332
negativně5228384101095095147190220241285336382
nabitých3934398101094992143164193237276325
oblastí4275398101094899121163198228249
v45393981010943
molekulách45973981010974123145189231281301344384433
a50453981010943
jejich510339810109226788109148197
správné5316398101093585114158199249294
orientaci.3934412101095080102148199228273314336355
Dipólové4314412101096183135186208258302347
momenty46864121010976126203249300330375
permanentně5087412101095198128205249299345396426477523
přítomné3934426101095384107139190269321369
v43334261010944
molekulách44064261010978130154201246299321367410462
jsou4897426101092360112165
dané5091426101095298150198
vazbou5319426101094490132186239291
mezi39344401010976123163185
atomy4145440101094474124201243
s44154401010936
rozdílnou4477440101093080119171193216267318369
elektronegativitou.4872440101094668115159192222272324371423467498519564586617667718738
Pro3934454101094979130
interakce4090454101092273104150181226270311357
mezi44734541010977124165187
indukovanými4687454101092173125176220270314360411454532554
dipóly5268454101095274126179202246
je5540454101092370
nutná39344681010950100130180223
blízká418246810109517394133176221
přítomnost4427468101095181103133182257308358393424
nepolárních4876468101095095147198220263293344365405455
oblastí53564681010949101123167202233254
dvou3934482101095195144194
molekul.41534821010975125147192235285307326
Vznik4504482101095089139160202
přechodného4731482101095181126168218268320370415466516
dipólu5272482101095172123174196246
je5542482101092268
způsoben3934496101093890140175225277324374
pohybem43244961010951102152194246292368
elektronů4708496101094567112155188217267317367
v50914961010943
molekulách,51504961010975125147193236286307351391441460
Obr.3405232011265120155174
2.536523201125076
Krystalografická657523801074269108139166209227272318344386409428465502546
struktura122352380107315783128165193239265307
osimertinibu155052380107457592163201227256274320338383429
(zeleně)199852380107245996114152198236258
navázaného2276523801074792130173209254300338384429
kovalentně2725523801073781119163181219266291337375
na3120523801074691
cystein3231523801073776107133170188234
(síra34855238010724526995138
cysteinu3642523801073876107133170188234280
žlutou394152380107365499125169215
kuličkou)4175523801073783101120157193237283304
receptoru4499523801072663100137182208252278323
pro4842523801074672115
EGF4977523801074093131
(PDB5127523801072466121164
ID:531152380107197591
7K1H)5421523801074282120169191
v3405348010738
trojrozměrném39453480107265296113139183218289327352399437508
zobrazení919534801073579125151193229266312330
(2A)1265534801072464113136
a14175348010745
dvojrozměrném1479534801074583127145171215249320358384430468540
zobrazení2035534801073679125151194230266313331
s23825348010731
legendou2429534801071957102141187232277323
(2B).2769534801072363104127140
Obrázky29255348010758104130173209245285
zpracovány3226534801073581107149187230268311358393
v36355348010738
programu3689534801074672116162187230301346
MOE40525348010768126166
2020.09014234534801074282121161177219260302340