604
www.klinickafarmakologie.cz340804301076513320121425327329234035839843647950254457164568672477179183988990895196610061045
/26478043010732
Klin272480430107446583131
Farmakol2872804301074178105179220258305325
Farm.3213804301074279105180196
2024;38(3):118-1223425804301074487129169183227271295337358373410444483512550588632
/41018043010732
KLINICKÁ4179804301074588109168189242288346
FARMAKOLOGIE4544804301074191138210265312372415474533554598
A51608043010753
FARMACIE5231804301074291138211266317337381
12156558026012657110164
PŘEHLEDOVÉ4549207012660124182256312369444520587645
ČLÁNKY5216207012660115187259327395
Vazebné356536501063673107139175217248
síly:38293650106314879112125
typy396936501063069104141
interakcí41263650106155688120156198233266284
léčiv44263650106286196113151
s4593365010631
molekulovými463936501065293124156192233264304341380433451
cíli5105365010633508299
v5220365010636
organismu527236501063874114154195213245299339
jenž343342101092266115153
může5113421010974122160204
vyvolat730342101094287132180201243272
vznik1017342101094382131151192
dočasného1224342101095099139182216265309359407
opačného1646342101094999142182230275324373
dipólového343356101095071121171192241283326376425
momentu7833561010974123197242292320369
v11673561010943
interagující122535610109217099143172215265313334355395415
molekule.16553561010974123145189231280301346364
Je343370101093379
dán441370101095194144
schopností604370101093677126176228279329364395416
apolárních1039370101094395145167211241291312353403
molekul14603701010975125147193236286308
se1786370101093682
polarizovat1886370101095210234338410109216594116155204247291321
(5)68238410109257094
a7943841010943
je855384101092268
tedy941384101092974126169
častější1128384101094085120151195217253274
u14203841010949
větších1487384101094388118155176217267
atomů1772384101094373122197247
nebo343398101095096147198
konjugovaných560398101094291142163213264314356400451492532582
systémů.1161398101093579115146191266316334
Hydrofobní4834118011264114170206261295350407463489
interakce1000411801122581116166204253305347397
jsou1425412101092360112164
IUPAC1618412101092384134187239
definovány18864121010953100343426101092753106159204251304348
jako730426101092268113165
tendence933426101093178132186234288331379
uhlovodíků13504261010951104128180226278333356403456
(tzn.1844426101092657100153175
hydrofobních343440101095091142171221247297349400421461511
molekul)8764401010975125147193236286307333
vytvářet1231440101094389122168212242287317
agregáty1570440101094394124169221264294339
ve1931440101094388
vodném343454101094393145195241317
prostředí686454101095282132168199228274326347
(14).1059454101092668110134151
Jedná1236454101093480132182226
se1488454101093682
o15964541010949
interakce1671454101092171101146176221263303348
alifatických34346810109436586113157187208248291336376426
nebo793468101095096148198
alicyklických101646810109436586126171214237258299341387427477
oblastí15174681010949101123167202233254
v17964681010943
molekulách18634681010975125343482101092167110160181225266316
(7).68048210109257197114
Přestože815482101094877122158189238276321
jsou1157482101092257107158
to1336482101092978
slabé1435482101093657101152199
interakce,1655482101092171100145175219262301346364
mohou3434961010974122171219268
hrát625496101094977120148
významnou788496101094287126175217290339387435
roli123849610109297697117
vzhledem1370496101094282130151195245289363
k17474961010941
tomu,1803496101092976150198216
že343510101093984
léčiva447510101092167108129173217
jsou684510101092257107157
převážné861510101095181126170214253303349
lipofilní123051010109214294144171195216266287
molekuly15375101010975125147193236286307350
(5).190751010109267095112
Vzdálenost343524101095088139182203249299348384414
interagujících773524101092171100144174218268317339360400421461511
atomů1300524101094372121196245
se1561524101093681
pohybuje16585241010951101151192244294316361
v3435381010943
rozmezí405538101093079117193239278299
0,33–0,42724538101094664112156203252271318361
nm10965381010950125
(12).1241538101092567107131148
Dále4835521010962107130178
mohou6895521010977129182234286
v10035521010945
navazování1076552101095197141187228280325371423445
léčiv1549552101092270113135181
na1758552101095197
cíle188355210109416488136
hrát343566101095181126156
roli525566101093080103125
π-elektrony676566101095079128150197240274304354406448
aromatických1150566101094474125202246277298340383429470521
systémů1697566101093680117149194271322
a3435801010943
interagovat409580101092171100145175219270320363407436
formou867580101092776107182232282
stohových1172580101093566115166216258304344394
(syn.1588580101092660104155174
patrových)1784580101095196125155204343594101094389129179202
interakcí566594101092171101146175220262302323
známých910594101093888132207249288338
také1269594101093075117161
jako1451594101092266108157
π-π1628593801125483138
(pí-pí)178759410109267799127180202231
interakce343607801122477110157192239287326373
(angl.731608101092565115165186204
π-stacking)951608101094976112142185225267289338388412
(7).137860810109267196113
Interagujícími150660810109217199143173216266315336357397417491512
partnery343622101095399130165217265297345
jsou717622101092360113165
aromatické912622101094576127206252283306348393439
oblasti13816221010951105129174212244267
molekul,16786221010977129153200245298321341
resp.343636101092975111162180
makromolekul5426361010975119161192242317367389435478528550
(17).1111636101092567107133150
Přirozeně48365010109487798128177215261311357
spolu864650101093687137159209
mohou10976501010975125176226276
interagovat1397650101092171101145175219270320363407437
také1858650101093074116161
oblasti,343664101094999120163197227247266
které624664101094173116145189
obecně8286641010949100145185234278
přispívají1122664101095079100134184205247290311332
k14696641010941
hydrofobicitě1525664101094990139168216241290341361401421450494
léčiv,343678101092166107128171185
tzn.544678101092970119138
aromatické698678101094372121196239268289329370414
oblasti11286781010949100122165200230251
s13946781010936
alifatickými144567810109436485111155184205245287332407428
oblastmi.18886781010949101343692101092165100131206227246
Závisí606692101094994136158193214
na836692101095094
okolní946692101094992141163213234
substituci,1196692101093585136172203224254303344365384
zda1596692101093990133
převáží1745692101095181126170213253274
hydrofobní343706101095194145176227254306359411433
interakce802706101092273104150181226269310356
nebo1185706101095198151203
dojde14147061010952103126179226
k16667061010943
indukci1736706101092173126177220261283
dipólu343720101095173125176198248
vlivem61772010109446687132177253
sousedních896720101093687137173219272322344385435
elektron-odtahujících/dodávajících135772010109466811415719022027032235140445648753258263234373410109224384105145195227274324376419462506527549589610651701
funkčních1063734101092677127169209259280321370
skupin,1453734101093578128179201251270
ale1742734101094365111
nejčastěji1872734101095096117343748101094084120151195217238
se600748101093682
zapojují701748101093884135186208257279300
obě10207481010950101148
tyto1187748101093075108157
interakce.1363748101092171100145175219262301346364
Halogenová4837618011262110134186239286339391437484
vazba985761801124795137191239
je1242762101092267
vazba1327762101094387125176219
atomu1565762101094372120195244
halogenu1827762101095093113162343776101095093142190
(s546776101092558
výjimkou617776101094387107127200241288336
fluoru)96677610109264896144173221243
s12227761010935
Lewisovou1271776101094285149169203251292339387
kyselinou1671776101094286120164184204252300348
v21383421010943
optimálním21953421010950100129150224266287335356430
úhlu2639342101094998119167
1802821342101094687133
°,2963342101092942
pod30193421010951101151
kterým3184342101094374118147191266
k34643421010943
sobě3521342101093584135180
interagující37153421010921702138356101093074103146196245265286325346
partneři2499356101095194123155204249278298
přistupují2813356101095180101135165214264314335355
(18)3183356101092667108132
a33303561010943
vzdáleností3389356101094383133176196241291340375404425
interagujících213837010109216997141169212261309329349388408447495
atomů2647370101094371119193241
zhruba2901370101093987115164214257
0,29–0,353171370101094663110154200248265312354
nm35343701010950123
(12).3671370101092566105127143
Donorem21383841010959108157206234278352
halogenové2503384101095092112161210255303352393436
vazby2953384101094385123173214
je3181384101092165
tedy3260384101093073123165
molekulový343938410109741231431872292772973462138398101094388
halogen2245398101095092113162213257307
nebo2570398101095095146196
halogen2784398101095093114163213258308
vázaný3110398101094386125169218259
v33873981010944
organické3449398101095079128171220240280321365
sloučenině2138412101093657107157198243293314364410
a25724121010944
akceptorem2641412101094486126170222252301331376452
halogenové3117412101095195116166217263314364407451
vazby3593412101094388127179221
je2138426101092268
elektronově2230426101094667113156188217267317367410455
bohatý27094261010952102153197226271
atom3004426101094474123199
(neutrální3227426101092674119169199229273294344364
atom3616426101094473122198
kyslíku,2138440101094287122142163206255273
dusíku24264401010951100134154198247
nebo2688440101095095146195
síry),289944010109355584129152169
alkeny3083440101094364105149198239
nebo3337440101095095145195
aromatické3547440101094472121196238213845410109305090131174
nenasycené2331454101095095144187222264303347396441
systémy.2791454101093578113143187262302317
Halogenová31264541010959102122171222267316365407450
vazba3595454101094386125176219
je2138468101092269
umožněna22324681010950127178217268314365410
díky2666468101095274118165
nerovnoměrné2856468101095197128178221273324401447477529575
distribuci3456468101095273109140170192244295337358
částečného2138482101094083117146189229278322371419
negativního2571482101095094144186214234277326346396444
náboje3029482101095092142191211255
v32984821010943
atomech3355482101094371119193237277325
halogenu,36944821010950922138496101092170121166215264282
která2437496101094273117146189
způsobuje2643496101093989139173222273322343388
vytvoření3048496101094388120165213242286336356
ekvatoriálního34204961010946871331762052532823033453662138510101095070121170
záporně2327510101093882133183212262306
nabitého2652510101095093143164193237287336
prstence3006510101095181116146190240280323
kolem3348510101094290111156230
vazby3597510101094386125176217
uhlík-halogen,2138524101095099119140183208258301321371421466515533
čímž2692524101094161135173
dojde28865241010951100121171216
u31235241010950
atomu3193524101094473121195244
halogenu3458524101095093113162213258307356
na2138538101095195
konci2258538101094393144185206
této2489538101093076106156
vazby2670538101094488128181223
k29185381010943
vytvoření2986538101094491124171220250296347368
pozitivního33795381010952104142163194215259311332384435
elektrostatického2138552101094567112155187216265300331375404424465506551601650
potenciálu,28135521010951102131175226266286330350400418
tzv.3255552101093071116130
sigma-díře3409552101093657107183226255308328360405
(angl.2138566101092666115165185203
δ-hole)2358566101094979129178200244267
(19).2642566101092567107130146
Obecně28055661010962114159200249294
stoupá3116566101093565113162213256
síla338956610109365678121
halogenové352756610109509211316221325721385801010950100142186
vazby2348580101094488126178220
od25925801010949101
chloru2717580101094090111160190240
přes2981580101095181125161
brom3166580101095181130205
k33955801010943
jodu3462580101092271123172
(20).3658580101092670115139156
V21385941010950
databázi2209594101095193122165216259298318
Protein2548594101094876124153197218267
Data28365941010960102131174
Bank3031594101094992141183
(PDB)3234594101092673131179203
(21),3457594101092670111130146
která3624594101094274118147190
shromažďuje2138608101093685113162237279318369417438483
experimentálně2639608101094587138183212233307352402430474494543588
zjištěné324560810109385980114144188237282
trojrozměrné354560810109295810712815620524221386221010975120149199244
struktury240562210109356594143185217265294339
makromolekul,27676221010975118159190238313362383428470519540558
včetně3348622101094382125155204249
komplexů36206221010942901652138636101095172116158207
léčiv2359636101092166106126168
s25426361010935
různými2591636101092978116165206280301
proteiny,2906636101095180128157200220269310323
je3243636101092267
dohledatelná3324636101095099148169213264306335378399448490
halogenová2138650101095195116167218264315366409453
vazba2616650101094488128180225
např.2866650101095194146176190
u30816501010951
diklofenaku3156650101095273116138189215261312356399450
(PDB3630650101092674134184
ID:213866410109228199
1PXX,2260664101094689137190209
obr.24926641010950101130144
3)2659664101094669
nebo2751664101095095145195
indometacinu2969664101092171121170245290319363403423472521
(PDB3513664101092572130179
ID:371566410109218199
2OYE21386781010946107152196
a23586781010943
2OYU)24256781010946106152210234
navázaných2683678101095093134177216260309350389438
v31456781010943
cyklooxygenáze3211678101094185127149198248288333382427477520558603
či2138692101094061
u22226921010950
diazepamu2296692101095171114153197248292367416
navázaného2735692101095093135178217261311356406455
na3214692101095093
lidský333169210109214192126168213
sérový3568692101093580110158201246
albumin2138706101094465116166242262312
(PDB2475706101092573132181
ID:2680706101092283101
2BXF)2805706101094795145188214
(19).3043706101092668109133149
Na32167061010960104
obrázku33447061010950102132175215257307
336757061010947
je3746706101092268
patrná2138720101095092120147196237
halogenová2388720101094990110157206249297345385427
vazba2828720101094384121171213
chloru3054720101093987106154182230
(tmavě3297720101092551123164204247
zeleně)3557720101093780100144192235257
diklofenaku2138734101095171112134183209254303346387437
na2592734101095092
kyslík2701734101094387122143163206
serinu2924734101093681110130180228
5303169734101094690135
ve3321734101094387
vazebném3425734101094386124169220269314389
místě2138748101097595130160203
cyklooxygenázy2359748101094084126148197247287332381426475518556601
(PDB2977748101092672131179
ID:317374810109228199
1PXX).3290748101094688137189216232
V22787621010950
databázi2358762101095196128174228274316339
PDB27267621010949110161
(https://www.rcsb.org)2917762101092577109143197235255290317386457529547579622661714734786818870897
jsou2138776101092362116170
dohledatelné23417761010952106161186236292339372421446500550
interakce2924776101092276109158191239285329377
i33347761010922
dalších33897761010952100125163188232286
léčiv.37087761010922723934342101094063109125
Je4088342101093482
možné41993421010975127167219267
si4495342101093558
je4582342101092269
prohlížet4680342101095284135187211234275322354
v50633421010943
jednoduché5135342101092270123175227281332375427475
zobrazovací3934356101094093149182230273327373421466490
aplikaci44553561010945100125149195244288312
přímo4799356101095386111191245
na5075356101095299
webu52053561010969117173227
bez54643561010952103146
nutnosti39343701010951105139194248287322346
dalšího43153701010953100125164189245299
software.4649370101093791121158231279312362384
V50683701010951
posledních51543701010953108148172222278333357402456
dvou3934384101095196147199
letech4153384101092269101148191243
přibyla4416384101095183106159203227273
také4709384101093076120166
možnost48963841010975126167219270308341
prohlížet5257384101095183134187210233274321353
i39343981010921
predikované3975398101095182129183206250300344390442489
modely44843981010975126180227251295
3D47993981010946107
struktur492639810109356899151195229281312
vypočtené52583981010943901441972402733203934412101095098
počítačem40584121010951103146169201247290336413
(CSM4497412101092678125199
=47224121010953
Computed48014121010952103180234286318364418
Structure5245412101094475106158201235286318365
Models).39344261010974128183232256295320340
Tyto4304426101094686123175
modely45094261010977130186234259305
jsou4845426101092260114167
předpovídány5043426101095285133188243297343368422469522567
pomocí39344401010951102179230273295
strojového424844010109356798149172223267312364415
učení4682440101094991137188211
a49124401010943
umělé49744401010949125172195242
inteligence.52354401010921721031491721942462933443934454101094087107
Představují4070454101094879126180218250297341393417440
alternativu453945410109446799146178230276307330376429
pro4997454101095183134
případ,5161454101095183106160206259280
kdy5470454101094295140
3D39344681010946107
struktura406046810109356798150194227278309355
biomakromolekul4434468101095174125202247290323373450501525572616667690
není5143468101095097149171
známa,5333468101093990135211256277
a39344821010943
umožňují40064821010950127179219271323346369
vědcům4404482101094490144187238315
hledání4748482101095073121175220272295
potenciálních50724821010951104136182235277300345369421444486538
léčiv,3934496101092169112135180197
která4154496101094277123155201
by4378496101095195
se4496496101093683
do46024961010951103
nich4728496101095073115167
mohla49184961010975127179202248
navazovat.5189496101095095139185226277322368399421
Nicméně3934510101096084128206255308357
úspěšnost4321510101095088142192230283336374408
hledání4759510101095174123178224277301
léčiv5090510101092170114138184
pomocí53045101010952106185238282306
těchto3934524101093078122174206258
predikovaných4222524101095285133187211256308353400453497539592
modelů48445241010976129184232257309
není5183524101095099152176
zatím5389524101093987119142221
zcela3934538101093981127151196
naplněná4153538101095095148172224271324369
(22).4545538101092572120145164
Další40745521010960105128165188
roli4288552101093081105128
v44425521010943
navazování4511552101095095139185226277322368420443
mohou49805521010975127179231283
hrát5289552101095081127158
příslušné54735521010951831063934566101093659110147198246
odpudivé41995661010950103156208261284330376
síly459456610109365983128
mezi47425661010975122163186
shodně4948566101093587139192244291
nabitými5259566101095095148171203250327350
částmi3934580101094189128162241265
molekul42305801010977131156205251305329
a45905801010944
také4665580101093078124172
solvatace4867580101093791116163210243291335383
molekul52805801010977131156205252305330
v39345941010942
biologickém3994594101095073123145196247269310352397472
systému.4484594101093579115146191267316336
Solvatace48385938011248101127175224257306348396
je5252594101092167
proces,5337594101095081130172217253273
při3934608101095081104
kterém4056608101094275120151197273
dochází43476081010950101143193237277300
k46656081010942
obklopení47256081010949101145169219271318369391
molekul51356081010974124147193237288310
rozpouštěné546460810109287811739346221010952105158196229276329377
látky434162210109216799144192
molekulami45636221010976129153201246299323369447471
rozpouštědla.5063622101093082123177230283321354401455479525547
Ve3934636101095094
vodném4055636101094394147199247324
prostředí4406636101095183134172204236282336359
se4792636101093583
jedná4901636101092269123175220
o51486361010949
hydrataci.5224636101094993145176222254300342365386
Pouze3934650101094898150191238
hydrofilní4201650101095094146177229257283306358381
části4611650101094086124156179
molekul48196501010975127151199243296319
mohou51676501010975127180231283
být5479650101095296131
v39346641010945
organismu4012664101095184139186240265304384437
solvatovány.4482664101093791117164212245298345393447492511
Lipofilní5026664101094468124178208236260314339
nebo53986641010951101157212
hydrofobní3934678101095197152186240270324381436460
části4433678101094290130164189
molekul46616781010977131157207254309334
nemohou50346781010951101182237292346401
být5474678101095299136
solvatovány.3934692101093690115162209242294341388441486504
Kolem44686921010950102127176256
jejich475469210109237296121164218
povrchu50026921010953107153186230283336
se5369692101093685
vytvářejí54856921010944933934706101093180128161210235259
uspořádané4225706101095190145200233281337384438488
vrstvy4744706101094579119153203253
molekul50287061010978132157206253307332
vody.5391706101094598154201219
Před3934720101094879125179
interakcí4141720101092173104150182228272314337
léčiva4505720101092169112135180226
s47597201010935
molekulárním48227201010975127151198243295318363395447470547
cílem539772010109406388135213
musí39347341010974125162184
dojít41377341010951102125148179
k43357341010942
desolvataci4396734101095097134186209254299330375417440
obou48557341010949102154205
interagujících5079734101092172103149180225277328351374415438480531
partnerů,3934748101095197129163215263294346367
což4327748101094091131
je4484748101092269
spojené4579748101093588141164212264312
s49167481010936
nutností49787481010950101133185237274307330
dodání53347481010950102156201253276
desolvatační3934762101095198136188212257303334381423475498
energie.4457762101094598145177229252300320
Při4803762101094878102
dostatečném49307621010951103140173219251297340392440517
přiblížení54737621010951831063934776101095277100142191244268
lipofilních423277610109214599153182209233286309353406
oblastí46687761010950105130176214248272
na4970776101095097
straně5097776101093670102149202251
léčiva5378776101092270115138185232
Obr.340609011265120155174
3.53260901125074
Krystalografická65161401074269108139166209227272318344386409428465502546
struktura12136140107315783128165193239265307
komplexu153661401073781153198217255293339
diklofenaku189161401074563100119164187224271316353398
(zeleně)23056140107245895114152198236258
navázaného257961401074691129173209253300338384429
ve302461401073875
vazebném311461401073882118155200247285356
místě348661401077290119145182
cyklooxygenázy368361401073876113132177223259299343382428473509548
(PDB424761401072466121164
ID:44276140107187590
1PXX)453361401074179121167192
v4741614010738
trojrozměrném47956140107265296113139183218289327352399437508
zobrazení53196140107367912515119423026634072401074664
(3A)42172401072363110133
a570724010746
dvojrozměrném63272401074583127145171215249321359384430469540
zobrazení118872401073680125151194230267313331
s1535724010731
legendou158372401071856102140186232277323
(3B).192272401072464106128141
Obrázky2079724010758104130173209246285
zpracovány238072401073581107150187230268312358394
v2790724010738
programu284472401074571115161187229300346
MOE3206724010768126166
2020.0901338872401074282121161178219260303340