KLINICKÁ FARMAKOLOGIE A FARMACIE / Klin Farmakol Farm. 2026;40(3):176-180 / www.klinickafarmakologie.cz 180 PŘEHLEDOVÉ ČLÁNKY Korelace genotypu a fenotypu CYP2C19: fenokonverze, populační specifika a moderní sekvenační přístupy v personalizované farmakoterapii že být vztah mezi genotypem a skutečným fenotypem klinicky závažný. Metodologický pokrok v oblasti NGS a sekvenování exomu tyto limity postupně překonává. Nové technologie umožňují detekce vzácných variant, CNV i přímé fázování haplotypů, které konvenčním metodám chybí. Předpokladem jejich smysluplného zavedení do rutinní praxe však není jen technologická připravenost laboratoří, ale i edukace lékařů a systémová integrace farmakogenetických dat do elektronické zdravotní dokumentace. Výsledek farmakogenetických testů je tedy třeba vnímat nikoli jako definitivní diagnózu, ale jako jeden ze vstupních parametrů klinického rozhodování. LITERATURA 1. Zanger UM, Schwab M. Cytochrome P450 enzymes in drug metabolism: Regulation of gene expression, enzyme activities, and impact of genetic variation. Pharmacol Ther. 2013;138:103-141. 2. Botton MR, Whirl-Carrillo M, Del Tredici AL, et al. PharmVar GeneFocus: CYP2C19. Clin Pharmacol Ther. 2021; 109:352-366. 3. Lima JJ, Thomas CD, Barbarino J, et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) Guideline for CYP2C19 and Proton Pump Inhibitor Dosing. Clin Pharmacol Ther. 2021;109:1417-1423. 4. Lee CR, Luzum JA, Sangkuhl K, et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium Guideline for CYP2C19 Genotype and Clopidogrel Therapy: 2022 Update. Clin Pharmacol Ther. 2022;112:959-967. 5. Beunk L, Nijenhuis M, Soree B, et al. Dutch Pharmacogenetics Working Group (DPWG) guideline for the gene-drug interaction between CYP2D6, CYP2C19 and non-SSRI/non- -TCA antidepressants. Eur J Hum Genet. 2024;32:1371-1377. 6. Relling MV, Evans WE. Pharmacogenomics in the clinic. Nature. 2015;526:343-350. 7. Shah RR, Smith RL. Addressing phenoconversion: The Achilles’ heel of personalized medicine. Br J Clin Pharmacol. 2015;79:222-240. 8. Klomp SD, Manson ML, Guchelaar HJ, et al. Phenoconversion of Cytochrome P450 Metabolism: A Systematic Review. J Clin Med. 2020;9:2890. 9. Petrović J, Pešić V, Lauschke VM. Frequencies of clinically important CYP2C19 and CYP2D6 alleles are graded across Europe. Eur J Hum Genet. 2020;28:88-94. 10. Proietti R, Maranho Neto GA, Kunzova S, et al. Pharmacogenomic profile of a central European urban random population-Czech population. PLoS One. 2023;18:e0284386. 11. Sibbing D, Koch W, Gebhard D, et al. Cytochrome 2C1917 allelic variant, platelet aggregation, bleeding events, and stent thrombosis in clopidogrel-treated patients with coronary stent placement. Circulation. 2010;121:512-518. 12. Tašková I, Šafářová N. TDM jako nástroj pro farmakogenetické profilování pacientů: kazuistika fenokonverze. Klin Farmakol Farm. 2025;39:206-212. 13. de Jong LM, Boussallami S, Sánchez-López E, et al. The impact of CYP2C19 genotype on phenoconversion by concomitant medication. Front Pharmacol. 2023;14:1201906. 14. Hakkola J, Hukkanen J, Turpeinen M, et al. Inhibition and induction of CYP enzymes in humans: an update. Arch Toxicol. 2020;94:3671-3722. 15. Stanke-Labesque F, Gautier-Veyret E, Chhun S, et al. Inflammation is a major regulator of drug metabolizing enzymes and transporters: Consequences for the personalization of drug treatment. Pharmacol Ther. 2020;215:107627. 16. Zhou S, Skaar DJ, Jacobson PA, et al. Pharmacogenomics of Medications Commonly Used in the Intensive Care Unit. Front Pharmacol. 2018;9:417867. 17. Duthaler U, Bachmann F, Suenderhauf C, et al. Liver Cirrhosis Affects the Pharmacokinetics of the Six Substrates of the Basel Phenotyping Cocktail Differently. Clin Pharmacokinet. 2022;61:1039-1055. 18. van der Lee M, Kriek M, Guchelaar HJ, et al. Technologies for Pharmacogenomics: A Review. Genes (Basel). 2020;11:1456. 19. Hippman C, Nislow C. Pharmacogenomic Testing: Clinical Evidence and Implementation Challenges. J Pers Med. 2019;9:40. 20. Pratt VM, Del Tredici AL, Hachad H, et al. Recommendations for Clinical CYP2C19 Genotyping Allele Selection: A Report of the Association for Molecular Pathology. J Mol Diagn. 2018;20:269-276. 21. Lopes JL, Harris K, Karow MB, et al. Targeted Genotyping in Clinical Pharmacogenomics: What Is Missing? J Mol Diagn. 2022;24:253-261. 22. Gaedigk A, Ingelman-Sundberg M, Miller NA, et al. The Pharmacogene Variation (PharmVar) Consortium: Incorporation of the Human Cytochrome P450 (CYP) Allele Nomenclature Database. Clin Pharmacol Ther. 2018;103:399-401. 23. Schwarz UI, Gulilat M, Kim RB. The Role of Next-Generation Sequencing in Pharmacogenetics and Pharmacogenomics. Cold Spring Harb Perspect Med. 2019;9:a033027. 24. Souche E, Beltran S, Brosens E, et al. Recommendations for whole genome sequencing in diagnostics for rare diseases. Eur J Hum Genet. 2022;30. 25. Tafazoli A, Guchelaar HJ, Miltyk W, et al. Applying Next-Generation Sequencing Platforms for Pharmacogenomic Testing in Clinical Practice. Front Pharmacol. 2021;12:693453. 26. Gaedigk A, Boone EC, Scherer SE, et al. CYP2C8, CYP2C9, and CYP2C19 Characterization Using Next-Generation Sequencing and Haplotype Analysis: A GeT-RM Collaborative Project. J Mol Diagn. 2022;24:337-350. 27. Ionova Y, Ashenhurst J, Zhan J, et al. CYP2C19 Allele Frequencies in Over 2.2 Million Direct-to-Consumer Genetics Research Participants and the Potential Implication for Prescriptions in a Large Health System. Clin Transl Sci. 2020;13:1298-1306. 28. Samarasinghe SR, Gaedigk A, Swen JJ, et al. Long-Read Sequencing Enhances Pharmacogenomic Profiling by Resolving Complex Haplotypes, Novel Star Alleles, and Structural Variants. Clin Pharmacol Ther. 2026;119:536-545. 29. Gurbel PA, Bliden K, Sherwood M, et al. Development of a routine bedside CYP2C19 genotype assessment program for antiplatelet therapy guidance in a community hospital catheterization laboratory. J Thromb Thrombolysis. 2024;57:566-575. 30. Ji Y, Skierka JM, Blommel JH, et al. Preemptive Pharmacogenomic Testing for Precision Medicine: A Comprehensive Analysis of Five Actionable Pharmacogenomic Genes Using Next-Generation DNA Sequencing and a Customized CYP2D6 Genotyping Cascade. J Mol Diagn. 2016;18:438-445. 31. Weitzel KW, Cavallari LH, Lesko LJ. Preemptive Panel-Based Pharmacogenetic Testing: The Time is Now. Pharm Res. 2017;34:1551-1555. 32. Lanillos J, Carcajona M, Maietta P, et al. Clinical pharmacogenetic analysis in 5,001 individuals with diagnostic Exome Sequencing data. NPJ Genom Med. 2022;7:12. 33. Wang L, Scherer SE, Bielinski SJ, et al. Implementation of preemptive DNA sequence–based pharmacogenomics testing across a large academic medical center: The Mayo-Baylor RIGHT 10K Study. Genet Med. 2022;24:1062-1072. 34. Klein TE, Ritchie MD. PharmCAT: A Pharmacogenomics Clinical Annotation Tool. Clin Pharmacol Ther. 2018; 104:19-22. 35. Joynt ACM, Axford MM, Chad L, et al. Understanding genetic variants of uncertain significance. Paediatr Child Health. 2022;27:10-11. 36. Kratochvíla J, Plzák Z. ČSN EN ISO 15189 (85 5101) Zdravotnické laboratoře – Požadavky na kvalitu a kompetenci. 3. vyd. Praha: Česká agentura pro standardizaci; 2023. 37. Češková E, Šilhán MP. Současnost a budoucnost farmakogenetického testování se zaměřením na farmakoterapii deprese. Psychiatr Praxi. 2024;25(2):71-75. 38. Národní strategie elektronického zdravotnictví ČR 20252035 [Internet]. Databáze strategií [cited 2026-04-21]. Available from: https://www.databaze-strategie.cz/cz/mzd/strategie/narodni-strategie-elektronickeho-zdravotnictvi-cr-20252035?typ=tab. 39. DiPha: Komplet softwarových nástrojů a jejich aplikací pro predikci a vedení účelné farmakoterapie pomocí digitalizované informace o farmakogenetických aspektech a lékových interakcích [Internet]. National Electronic Tool [cited 2026-05-21]. Available from: https://nen.nipez.cz/en/verejne- -zakazky/detail-zakazky/N006-25-V00040879. 40. Krejčí A, Müller P, Vojtěšek B. Bioinformatika a sekvenování nové generace (Bioinformatics and Next-generation Sequencing). Klin Onkol. 2015;28:2-91. 41. Ceník vyšetření [Internet]. GHC Genetics [cited 2026-05-21]. Available from: https://www.ghcgenetics.cz/cenik-vysetreni. 42. Změny v úhradách vyšetření metodou NGS [Internet]. SLG.cz [cited 2026-05-21]. Available from: https://slg.cz/ aktuality/zmeny-v-uhradach-vysetreni-metodou-ngs/. 43. Morris SA, Alsaidi AT, Verbyla A, et al. Cost Effectiveness of Pharmacogenetic Testing for Drugs with Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) Guidelines: A Systematic Review. Clin Pharmacol Ther. 2022;112:1318-1328. 44. Haidar CE, Crews KR, Hoffman JM, et al. Advancing Pharmacogenomics from Single-Gene to Preemptive Testing. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2022;23:449-473. 45. Slanař O. Farmakogenomika – současnost, budoucnost, perspektiva. Klin Farmakol Farm. 2012;26:126-130.
RkJQdWJsaXNoZXIy NDA4Mjc=