Klin Farmakol Farm. 2026;40(3):176-180 | DOI: 10.36290/far.2026.027

Korelace genotypu a fenotypu CYP2C19: fenokonverze, populační specifika a moderní sekvenační přístupy v personalizované farmakoterapii

Jan Soukop, Marek Pecha, Pavel Anzenbacher
Ústav farmakologie Fakultní nemocnice Olomouc a Lékařské fakulty Univerzity Palackého v Olomouci

Cytochrom P450 2C19 (CYP2C19) hraje klíčovou roli v metabolismu mnoha běžně užívaných léčiv, včetně klopidogrelu, antidepresiv či inhibitorů protonové pumpy. Ačkoli je genotypizace genu CYP2C19 užitečným nástrojem personalizované medicíny, v klinické praxi často naráží na fenomén fenokonverze, kdy reálný fenotyp (enzymatická aktivita) pacienta neodpovídá genetickému předpokladu. Tento jev je nejčastěji způsoben lékovými interakcemi mezi induktory a inhibitory CYP nebo komorbiditami pacienta. Ve středoevropské populaci je distribuce alel charakterizována podprůměrnou prevalencí loss-of-function alely *2 (cca 7-8 %) a nadprůměrnou prevalencí gain-of-function alely *17 (cca 29 %), což zvyšuje riziko chybné interpretace farmakogenetických výsledků. Konvenční PCR metody detekují pouze předem definované varianty a neumožňují tzv. haplotype phasing. Sekvenování nové generace (NGS) a sekvenování exomu (WES) tyto limity překonávají, avšak za cenu vyšší interpretační a organizační náročnosti. Znalost lokálních populačních specifik a rizik fenokonverze je nezbytným předpokladem pro bezpečnou individualizaci farmakoterapie.

Klíčová slova: CYP2C19, farmakogenetika, genotyp, fenotyp, fenokonverze, lékové interakce, sekvenování nové generace, personalizovaná medicína.

Genotype-phenotype correlation of CYP2C19: phenoconversion, population-specific characteristics, and modern sequencing approaches in personalised pharmacotherapy

Cytochrome P450 2C19 (CYP2C19) plays a key role in the metabolism of many commonly used medicines, including clopidogrel, antidepressants and proton pump inhibitors. Although CYP2C19 genotyping is a useful tool in personalised medicine, its clinical application is often complicated by the phenomenon of phenoconversion, in which the patient's actual phenotype (enzymatic activity) does not correspond to the genetically predicted phenotype. This phenomenon is most commonly caused by drug-drug interactions involving CYP inducers and inhibitors or by patient comorbidi­ties. In Central European populations, the distribution of alleles is characterised by a below-average prevalence of the loss-of-function allele *2 (approximately 7-8%) and an above-average prevalence of the gain-of-function allele *17 (approximately 29%), increasing the risk of misinterpretation of pharmacogenetic findings. Conventional PCR methods detect only predefined variants and do not allow so-called haplotype phasing. Next-generation sequencing (NGS) and whole-exome sequencing (WES) overcome these limitations, albeit at the cost of greater interpretative and organisational complexity. Knowledge of local population-specific characteristics and the risk of phenoconversion is essential for the safe individualisation of pharmacotherapy.

Keywords: CYP2C19, pharmacogenetics, genotype, phenotype, phenoconversion, drug interactions, next-generation sequencing, personalised medicine.

Vloženo: 25. květen 2026; Revidováno: 22. červen 2026; Přijato: 1. červenec 2026; Zveřejněno: 14. říjen 2026  Zobrazit citaci

ACS AIP APA ASA Harvard Chicago Chicago Notes IEEE ISO690 MLA NLM Turabian Vancouver
Soukop J, Pecha M, Anzenbacher P. Korelace genotypu a fenotypu CYP2C19: fenokonverze, populační specifika a moderní sekvenační přístupy v personalizované farmakoterapii. Klin Farmakol Farm. 2026;40(3):176-180. doi: 10.36290/far.2026.027.
Sdílet...
Stáhnout citaci
  • BibTeX (.bib)
  • Bookends (.ris)
  • EasyBib (.ris)
  • EndNote (.enw)
  • EndNote 8 (.xml)
  • ISI WoS (.isi)
  • Medlars (.medlars)
  • Mendeley (.ris)
  • MODS (.xml)
  • Papers (.ris)
  • RefWorks (.txt)
  • RefManager (.ris)
  • RIS (.ris)
  • MS Word (.xml)
  • Zotero (.ris)
    • Zobrazit celý článek

    Reference

    1. Zanger UM, Schwab M. Cytochrome P450 enzymes in drug metabolism: Regulation of gene expression, enzyme activities, and impact of genetic variation. Pharmacol Ther. 2013;138:103-141. Přejít k původnímu zdroji...
    2. Botton MR, Whirl-Carrillo M, Del Tredici AL, et al. PharmVar GeneFocus: CYP2C19. Clin Pharmacol Ther. 2021; 109:352-366. Přejít k původnímu zdroji...
    3. Lima JJ, Thomas CD, Barbarino J, et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) Guideline for CYP2C19 and Proton Pump Inhibitor Dosing. Clin Pharmacol Ther. 2021;109:1417-1423. Přejít k původnímu zdroji...
    4. Lee CR, Luzum JA, Sangkuhl K, et al. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium Guideline for CYP2C19 Genotype and Clopidogrel Therapy: 2022 Update. Clin Pharmacol Ther. 2022;112:959-967. Přejít k původnímu zdroji...
    5. Beunk L, Nijenhuis M, Soree B, et al. Dutch Pharmacogenetics Working Group (DPWG) guideline for the gene-drug interaction between CYP2D6, CYP2C19 and non-SSRI/non-TCA antidepressants. Eur J Hum Genet. 2024;32:1371-1377. Přejít k původnímu zdroji...
    6. Relling MV, Evans WE. Pharmacogenomics in the clinic. Nature. 2015;526:343-350. Přejít k původnímu zdroji...
    7. Shah RR, Smith RL. Addressing phenoconversion: The Achilles' heel of personalized medicine. Br J Clin Pharmacol. 2015;79:222-240. Přejít k původnímu zdroji...
    8. Klomp SD, Manson ML, Guchelaar HJ, et al. Phenoconversion of Cytochrome P450 Metabolism: A Systematic Review. J Clin Med. 2020;9:2890. Přejít k původnímu zdroji...
    9. Petrović J, Pešić V, Lauschke VM. Frequencies of clinically important CYP2C19 and CYP2D6 alleles are graded across Europe. Eur J Hum Genet. 2020;28:88-94. Přejít k původnímu zdroji...
    10. Proietti R, Maranho Neto GA, Kunzova S, et al. Pharmacogenomic profile of a central European urban random population-Czech population. PLoS One. 2023;18:e0284386. Přejít k původnímu zdroji...
    11. Sibbing D, Koch W, Gebhard D, et al. Cytochrome 2C1917 allelic variant, platelet aggregation, bleeding events, and stent thrombosis in clopidogrel-treated patients with coronary stent placement. Circulation. 2010;121:512-518. Přejít k původnímu zdroji...
    12. Tašková I, Šafářová N. TDM jako nástroj pro farmakogenetické profilování pacientů: kazuistika fenokonverze. Klin Farmakol Farm. 2025;39:206-212. Přejít k původnímu zdroji...
    13. de Jong LM, Boussallami S, Sánchez-López E, et al. The impact of CYP2C19 genotype on phenoconversion by concomitant medication. Front Pharmacol. 2023;14:1201906. Přejít k původnímu zdroji...
    14. Hakkola J, Hukkanen J, Turpeinen M, et al. Inhibition and induction of CYP enzymes in humans: an update. Arch Toxicol. 2020;94:3671-3722. Přejít k původnímu zdroji...
    15. Stanke-Labesque F, Gautier-Veyret E, Chhun S, et al. Inflammation is a major regulator of drug metabolizing enzymes and transporters: Consequences for the personalization of drug treatment. Pharmacol Ther. 2020;215:107627. Přejít k původnímu zdroji...
    16. Zhou S, Skaar DJ, Jacobson PA, et al. Pharmacogenomics of Medications Commonly Used in the Intensive Care Unit. Front Pharmacol. 2018;9:417867. Přejít k původnímu zdroji...
    17. Duthaler U, Bachmann F, Suenderhauf C, et al. Liver Cirrhosis Affects the Pharmacokinetics of the Six Substrates of the Basel Phenotyping Cocktail Differently. Clin Pharmacokinet. 2022;61:1039-1055. Přejít k původnímu zdroji...
    18. van der Lee M, Kriek M, Guchelaar HJ, et al. Technologies for Pharmacogenomics: A Review. Genes (Basel). 2020;11:1456. Přejít k původnímu zdroji...
    19. Hippman C, Nislow C. Pharmacogenomic Testing: Clinical Evidence and Implementation Challenges. J Pers Med. 2019;9:40. Přejít k původnímu zdroji...
    20. Pratt VM, Del Tredici AL, Hachad H, et al. Recommendations for Clinical CYP2C19 Genotyping Allele Selection: A Report of the Association for Molecular Pathology. J Mol Diagn. 2018;20:269-276. Přejít k původnímu zdroji...
    21. Lopes JL, Harris K, Karow MB, et al. Targeted Genotyping in Clinical Pharmacogenomics: What Is Missing? J Mol Diagn. 2022;24:253-261. Přejít k původnímu zdroji...
    22. Gaedigk A, Ingelman-Sundberg M, Miller NA, et al. The Pharmacogene Variation (PharmVar) Consortium: Incorporation of the Human Cytochrome P450 (CYP) Allele Nomenclature Database. Clin Pharmacol Ther. 2018;103:399-401. Přejít k původnímu zdroji...
    23. Schwarz UI, Gulilat M, Kim RB. The Role of Next-Generation Sequencing in Pharmacogenetics and Pharmacogenomics. Cold Spring Harb Perspect Med. 2019;9:a033027. Přejít k původnímu zdroji...
    24. Souche E, Beltran S, Brosens E, et al. Recommendations for whole genome sequencing in diagnostics for rare diseases. Eur J Hum Genet. 2022;30. Přejít k původnímu zdroji...
    25. Tafazoli A, Guchelaar HJ, Miltyk W, et al. Applying Next-Generation Sequencing Platforms for Pharmacogenomic Testing in Clinical Practice. Front Pharmacol. 2021;12:693453. Přejít k původnímu zdroji...
    26. Gaedigk A, Boone EC, Scherer SE, et al. CYP2C8, CYP2C9, and CYP2C19 Characterization Using Next-Generation Sequencing and Haplotype Analysis: A GeT-RM Collaborative Project. J Mol Diagn. 2022;24:337-350. Přejít k původnímu zdroji...
    27. Ionova Y, Ashenhurst J, Zhan J, et al. CYP2C19 Allele Frequencies in Over 2.2 Million Direct-to-Consumer Genetics Research Participants and the Potential Implication for Prescriptions in a Large Health System. Clin Transl Sci. 2020;13:1298-1306. Přejít k původnímu zdroji...
    28. Samarasinghe SR, Gaedigk A, Swen JJ, et al. Long-Read Sequencing Enhances Pharmacogenomic Profiling by Resolving Complex Haplotypes, Novel Star Alleles, and Structural Variants. Clin Pharmacol Ther. 2026;119:536-545. Přejít k původnímu zdroji...
    29. Gurbel PA, Bliden K, Sherwood M, et al. Development of a routine bedside CYP2C19 genotype assessment program for antiplatelet therapy guidance in a community hospital catheterization laboratory. J Thromb Thrombolysis. 2024;57:566-575. Přejít k původnímu zdroji...
    30. Ji Y, Skierka JM, Blommel JH, et al. Preemptive Pharmacogenomic Testing for Precision Medicine: A Comprehensive Analysis of Five Actionable Pharmacogenomic Genes Using Next-Generation DNA Sequencing and a Customized CYP2D6 Genotyping Cascade. J Mol Diagn. 2016;18:438-445. Přejít k původnímu zdroji...
    31. Weitzel KW, Cavallari LH, Lesko LJ. Preemptive Panel-Based Pharmacogenetic Testing: The Time is Now. Pharm Res. 2017;34:1551-1555. Přejít k původnímu zdroji...
    32. Lanillos J, Carcajona M, Maietta P, et al. Clinical pharmacogenetic analysis in 5,001 individuals with diagnostic Exome Sequencing data. NPJ Genom Med. 2022;7:12. Přejít k původnímu zdroji...
    33. Wang L, Scherer SE, Bielinski SJ, et al. Implementation of preemptive DNA sequence-based pharmacogenomics testing across a large academic medical center: The Mayo-Baylor RIGHT 10K Study. Genet Med. 2022;24:1062-1072. Přejít k původnímu zdroji...
    34. Klein TE, Ritchie MD. PharmCAT: A Pharmacogenomics Clinical Annotation Tool. Clin Pharmacol Ther. 2018; 104:19-22. Přejít k původnímu zdroji...
    35. Joynt ACM, Axford MM, Chad L, et al. Understanding genetic variants of uncertain significance. Paediatr Child Health. 2022;27:10-11. Přejít k původnímu zdroji...
    36. Kratochvíla J, Plzák Z. ČSN EN ISO 15189 (85 5101) Zdravotnické laboratoře - Požadavky na kvalitu a kompetenci. 3. vyd. Praha: Česká agentura pro standardizaci; 2023.
    37. Češková E, Šilhán MP. Současnost a budoucnost farmakogenetického testování se zaměřením na farmakoterapii deprese. Psychiatr Praxi. 2024;25(2):71-75. Přejít k původnímu zdroji...
    38. Národní strategie elektronického zdravotnictví ČR 2025-2035 [Internet]. Databáze strategií [cited 2026-04-21]. Available from: https://www.databaze-strategie.cz/cz/mzd/strategie/narodni-strategie-elektronickeho-zdravotnictvi-cr-2025-2035?typ=tab.
    39. DiPha: Komplet softwarových nástrojů a jejich aplikací pro predikci a vedení účelné farmakoterapie pomocí digitalizované informace o farmakogenetických aspektech a lékových interakcích [Internet]. National Electronic Tool [cited 2026-05-21]. Available from: https://nen.nipez.cz/en/verejne-zakazky/detail-zakazky/N006-25-V00040879.
    40. Krejčí A, Müller P, Vojtěšek B. Bioinformatika a sekvenování nové generace (Bioinformatics and Next-generation Sequencing). Klin Onkol. 2015;28:2-91. Přejít k původnímu zdroji...
    41. Ceník vyšetření [Internet]. GHC Genetics [cited 2026-05-21]. Available from: https://www.ghcgenetics.cz/cenik-vysetreni.
    42. Změny v úhradách vyšetření metodou NGS [Internet]. SLG.cz [cited 2026-05-21]. Available from: https://slg.cz/aktuality/zmeny-v-uhradach-vysetreni-metodou-ngs/.
    43. Morris SA, Alsaidi AT, Verbyla A, et al. Cost Effectiveness of Pharmacogenetic Testing for Drugs with Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) Guidelines: A Systematic Review. Clin Pharmacol Ther. 2022;112:1318-1328. Přejít k původnímu zdroji...
    44. Haidar CE, Crews KR, Hoffman JM, et al. Advancing Pharmacogenomics from Single-Gene to Preemptive Testing. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2022;23:449-473. Přejít k původnímu zdroji...
    45. Slanař O. Farmakogenomika - současnost, budoucnost, perspektiva. Klin Farmakol Farm. 2012;26:126-130.

    Zpět na obsah


    Klinická farmakologie a farmacie

    Vážená paní, pane,
    upozorňujeme Vás, že webové stránky, na které hodláte vstoupit, nejsou určeny široké veřejnosti, neboť obsahují odborné informace o léčivých přípravcích, včetně reklamních sdělení, vztahující se k léčivým přípravkům. Tyto informace a sdělení jsou určena výhradně odborníkům dle §2a zákona č.40/1995 Sb., tedy osobám oprávněným léčivé přípravky předepisovat nebo vydávat (dále jen odborník).
    Vezměte v potaz, že nejste-li odborník, vystavujete se riziku ohrožení svého zdraví, popřípadě i zdraví dalších osob, pokud byste získané informace nesprávně pochopil(a) či interpretoval(a), a to zejména reklamní sdělení, která mohou být součástí těchto stránek, či je využil(a) pro stanovení vlastní diagnózy nebo léčebného postupu, ať už ve vztahu k sobě osobně nebo ve vztahu k dalším osobám.

    Prohlašuji:

    1. že jsem se s výše uvedeným poučením seznámil(a),
    2. že jsem odborníkem ve smyslu zákona č.40/1995 Sb. o regulaci reklamy v platném znění a jsem si vědom(a) rizik, kterým by se jiná osoba než odborník vstupem na tyto stránky vystavovala.

    Ne
    Ano

    Pokud vaše prohlášení není pravdivé, upozorňujeme Vás,
    že se vystavujete riziku ohrožení svého zdraví, popřípadě i zdraví dalších osob.